More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4950 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  47.06 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  168  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  44.29 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  41.36 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  35.11 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.09 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.09 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.09 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  39.22 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  39.22 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4080  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3439  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  39.19 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  39.73 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  41.52 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  41.47 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.16 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  39.46 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  37.22 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  38.68 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.18 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2732  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  39.46 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  41.36 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>