More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3910 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3910  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.598174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.36 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.36 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  46.01 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.51 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  45.12 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  47.87 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  46.45 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.19 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  43.13 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  40.64 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  46.92 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.67 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  40.18 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.6 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.59 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.47 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.65 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  41.86 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.13 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.13 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.07 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.19 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  44.13 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  44.13 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.13 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  44.13 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  42.13 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.79 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.66 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  43.19 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.06 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.06 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.06 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  40.76 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  42.72 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  42.72 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  42.79 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  43.26 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.71 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  41.86 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.66 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.66 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.66 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.66 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.66 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  41.4 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  38.97 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  41.4 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  41.4 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  43.19 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.25 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.47 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>