More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0746 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4080  two component transcriptional regulator  57.85 
 
 		 224 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3439  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 224 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2732  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 224 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1725  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  42.01 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  41.01 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  37.9 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 228 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  39.27 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.27 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  40.72 
 
 		 221 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  35.45 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.2 
 
 		 218 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.43 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0705  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.8 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  35.94 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 224 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 229 aa  145  9e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  39.55 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  39.55 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  39.55 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2580  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  39.55 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.84 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  39.46 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  39.55 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.37 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1596  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.37 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.37 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  37.95 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  36.49 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  37.44 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  37.44 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  41.01 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.09 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.72 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  35.19 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.39 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>