More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3715 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  46.36 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 222 aa  177  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.34 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.73 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  45.37 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  40.27 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.27 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.27 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.27 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.92 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.22 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0933  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  43.18 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  42.08 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  40.27 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.92 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.79 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  43.75 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.44 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 223 aa  158  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  42.08 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  42.34 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  37.67 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.34 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.34 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.34 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  42.34 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  41.82 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.99 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>