More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2217 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  92.38 
 
 		 223 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7229  two-component response regulator  43.61 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  42.6 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  36.65 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  41.89 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  36.77 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  151  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  41.74 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2017  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.406269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5713  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  37.73 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  39.91 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  38.74 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.67 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.29 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  41.63 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  34.38 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2732  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0036  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4240  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.98 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4530  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  34.38 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3910  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.598174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  36.49 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  36.49 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  36.49 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4359  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  36.49 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  36.49 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>