More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3471 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  66.36 
 
 		 224 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  66.36 
 
 		 224 aa  291  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  45.95 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  43.64 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  46.02 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  46.4 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  45.54 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  45.54 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  45.54 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  45.54 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  45.54 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  45.54 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.95 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  41.82 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  41.82 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  41.82 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  41.82 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  44.39 
 
 		 267 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  41.82 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  41.82 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  41.82 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.91 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  45.09 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  42.08 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  43.75 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  41.38 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>