More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3535 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  95.73 
 
 		 234 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.06 
 
 		 236 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3552  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.49 
 
 		 236 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  67.39 
 
 		 228 aa  290  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.83 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.19 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.84 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.78 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  50.66 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  50.66 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 273 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  49.35 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  49.35 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  46.52 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.92 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1697  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0568357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 224 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 221 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.29 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>