More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1697 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1697  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  456  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0568357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.98 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  43.78 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3686  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.35 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  44.21 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  43.72 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  43.72 
 
 		 252 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  43.72 
 
 		 252 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  43.72 
 
 		 252 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  43.72 
 
 		 287 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  43.72 
 
 		 252 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.49 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3552  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.57 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  41.05 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.3 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0041  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  42.24 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  41.67 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  42.24 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>