More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0041 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0041  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  463  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0036  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.41 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3274  two component transcriptional regulator  67.53 
 
 		 230 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.644217  normal  0.18395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.13 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  44.54 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  45.61 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  45.18 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  45.18 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  45.18 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  45.18 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  45.18 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  45.18 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2073  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.847769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 247 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 273 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2401  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  45.18 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  44.93 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1641  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.0712727 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 220 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1697  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0568357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 221 aa  168  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  41.67 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  43.91 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3802  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  0.282515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.11 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>