More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2516 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  92.38 
 
 		 223 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7229  two-component response regulator  43.61 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  42.6 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  38.57 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  44.04 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  42.2 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 229 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2350  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5713  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  37.27 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2017  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.406269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0036  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.67 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  40.09 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  42.99 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  38.74 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  38.22 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  38.22 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4530  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  33.93 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.84 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0041  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  38.39 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  38.39 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  35.27 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.98 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4240  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  39.37 
 
 		 228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>