More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4163 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  56.62 
 
 		 227 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  45.21 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 266 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 273 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  42.86 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.5 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 291 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  42.73 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 224 aa  193  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.27 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  46.33 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  43.06 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  43.06 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  41.89 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  41.89 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6693  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.91 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.27 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  42.92 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  42.92 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  42.92 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  42.92 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  42.92 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.66 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  43.44 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  42.92 
 
 		 287 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.66 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  42.66 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.66 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.66 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  42.66 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 220 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>