More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1725 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1725  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2732  two component transcriptional regulator  79.46 
 
 		 224 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3439  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 224 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4080  two component transcriptional regulator  80.36 
 
 		 224 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  39.82 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  38.89 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  38.36 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.67 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3910  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.598174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.55 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  38.18 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.36 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.36 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  37.73 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  37.18 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.36 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  35.45 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  34.51 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  34.07 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.59 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.91 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  37.56 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  36.64 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  35.75 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  36.96 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  36.96 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  35 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  35.59 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  36.96 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  36.96 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5331  transcriptional regulator two components regulatory system  35.5 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  36.96 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  34.56 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  32.43 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>