More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6194 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  62.73 
 
 		 221 aa  284  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  62.39 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.22 
 
 		 221 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  63.59 
 
 		 221 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.45 
 
 		 224 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  62.1 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  64.41 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.82 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.36 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  62.62 
 
 		 220 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  62.62 
 
 		 220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  58.45 
 
 		 224 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  59.82 
 
 		 223 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  59.09 
 
 		 223 aa  267  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  59.36 
 
 		 257 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.64 
 
 		 236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  59.36 
 
 		 224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  59.28 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  57.73 
 
 		 223 aa  264  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  59.28 
 
 		 225 aa  264  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.28 
 
 		 225 aa  264  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.28 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 223 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.11 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 229 aa  261  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  60.27 
 
 		 225 aa  262  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  60.19 
 
 		 227 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  57.41 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  56.36 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 		 221 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  59.46 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.73 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  59.73 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  54.84 
 
 		 221 aa  246  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  60.73 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  59.36 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  62.15 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1660  two component transcriptional regulator  60.28 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.48 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  55.86 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 220 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.6 
 
 		 222 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  49.53 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  50.91 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  49.07 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  49.33 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.67 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1388  transcriptional regulatory protein PhoP  50 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  53.24 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.78 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  50.46 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  52.56 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  45.74 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  50.46 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  47.71 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1679  transcriptional regulatory protein PhoP, putative  48.65 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3709  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.65 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  49.53 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  46.26 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49180  two-component response regulator PhoP  48.2 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>