More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0140 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  53.74 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  42.67 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  37.79 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0590  transcriptional regulatory protein, C  60 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  34.86 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  33.92 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  34.58 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  36.41 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  33.64 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  32.11 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  32.27 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  30.41 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  35.27 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  34.91 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  32.27 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  32.29 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  31.25 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  32.26 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  29.28 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.18 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  32.44 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  28.05 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  31.56 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  32.27 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.73 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  28.57 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.6 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.46 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  28.72 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  26.05 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2721  DNA-binding response regulator  27.03 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0418  two-component system response regulator  30.77 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.815166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  28.51 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.28 
 
 		 226 aa  98.2  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  30.91 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  27.6 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  27.85 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  32.29 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  27.31 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  28.97 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.05 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2524  DNA-binding response regulator  26.82 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.31 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3181  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.55 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  26.11 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.14 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  28.18 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  26.73 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  31.05 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  28.31 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  28.51 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.14 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.22 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2611  two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  25.68 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.23 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>