More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0363 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  41.44 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  37.73 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  37.39 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  37.27 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.09 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  32.73 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  34.55 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  38.46 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  35.81 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  32.58 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  29.02 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.55 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 476 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.54 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  27.19 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.09 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.69 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  28.08 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.2 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  27.52 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  30.05 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  28.43 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  27.49 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  29.56 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  32.27 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 636 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  29.65 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05980  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.22 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.553702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.29 
 
 		 616 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.19 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0106  response regulator receiver  39.5 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 547 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.17 
 
 		 438 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.47 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36 
 
 		 709 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  29.15 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  29.55 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  29.09 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1086  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.94 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  29.13 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  30.2 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 547 aa  91.7  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.59 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 517 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.2 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  30.5 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0827  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.914575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  28.5 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 502 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  29 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.88 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.76 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  33.97 
 
 		 566 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>