More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1443 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  38.33 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  33.49 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  33.64 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  31.34 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  30.67 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  27.98 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  29.55 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  31.65 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.82 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0590  transcriptional regulatory protein, C  46.9 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  30.7 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  29.78 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  28.5 
 
 		 220 aa  98.6  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.05 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  27.98 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  26.05 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.45 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.7 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  27.19 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  28.77 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.93 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  27.11 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  26.91 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  28.11 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  28.33 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.22 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  26.91 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  27.51 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.4 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  27.06 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.66 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  27.88 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  27.15 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  25.46 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  26.01 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  27.87 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  27.91 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.61 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.9 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  25.56 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  27.35 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  27.85 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6806  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  28.32 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.24 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.79 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.03 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.91 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  28.75 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  27.39 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  26.48 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  25.45 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.87 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  26.94 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  26.94 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  26.94 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  26.94 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  26.94 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  26.94 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  22.79 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  26.94 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  26.13 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  26.94 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  26.41 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  27.4 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  25.76 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.58 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  26.01 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  26.01 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.34 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.77 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  27.65 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2935  two component transcriptional regulator  24.64 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000047512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  26.82 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.58 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  24.67 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.31 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  26.91 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  26.73 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>