More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0257 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  48.18 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  38.36 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  36.99 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  36.57 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  38.07 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  39.35 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  38.81 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  38.07 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  37.33 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  36.99 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  34.1 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01884  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  35.59 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000533293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01874  hypothetical protein  35.59 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000061937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  38.14 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2748  transcriptional regulatory protein YedW  35.59 
 
 		 233 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892088  normal  0.227347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1216  transcriptional regulatory protein YedW  35.59 
 
 		 260 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000203871  normal  0.637592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0914  transcriptional regulatory protein YedW  35.59 
 
 		 260 aa  127  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2200  transcriptional regulatory protein YedW  35.59 
 
 		 260 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000454941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1676  transcriptional regulatory protein YedW  35.59 
 
 		 260 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000350308  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2070  transcriptional regulatory protein YedW  35.59 
 
 		 260 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.15395e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  34.13 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1682  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000361446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  31.96 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  38.31 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  31.84 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  31.67 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.67 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 247 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.23 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2735  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.089268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3918  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  31 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  30.94 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  33.64 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2570  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000747651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  31.82 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  32.43 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  30.32 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  30.18 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  32.3 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>