More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4670 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0844  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.96 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000660959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 273 aa  204  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  51.12 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 406 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.65 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  49.33 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  47.81 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 240 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.11 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  49.33 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  47.75 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.62 
 
 		 271 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.92 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.92 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  45.74 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  47.6 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  42.73 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.89 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5525  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.997238 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  41.63 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 252 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  42.92 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.48 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  45.74 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.62 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>