More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0732 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.88 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.18 
 
 		 230 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.22 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.01 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  50.9 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  52.7 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  46.4 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  49.33 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.22 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  57.47 
 
 		 223 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  52.27 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 223 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.21 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.09 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.21 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  48.89 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  47.77 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.58 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.66 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  47.98 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.67 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  47.98 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.21 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  47.51 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  46.64 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0577  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0903513 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  46.64 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  46.19 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  46.64 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 227 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0752  hypothetical protein  46.61 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.77 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  49.78 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  45.54 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.43 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2725  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 		 227 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0708  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328024  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  47.51 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.13 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  47.06 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  47.06 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  47.06 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>