More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1849 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.91 
 
 		 230 aa  309  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.96 
 
 		 228 aa  304  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0577  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0903513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 266 aa  239  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.54 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.54 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.54 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.54 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  45.09 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.09 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  45.09 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.2 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.2 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  44.2 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  45.54 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  46.43 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  44.93 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  45.54 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  45.54 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.75 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.67 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.98 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.39 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.98 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  46.43 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  44.2 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.67 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  46.67 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  45.98 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  45.98 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  44.25 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  44.64 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.25 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.3 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  41.78 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.09 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1292  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  43.75 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.26 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  43.05 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.89 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  40.71 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  42.92 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>