More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5525 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5525  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.997238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  68 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.95 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.68 
 
 		 232 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.39 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.53 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.22 
 
 		 279 aa  288  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.58 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.86 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  57.76 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.06 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.37 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  61.99 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  53.65 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  52.05 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 272 aa  184  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  45.8 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.3 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  50.44 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  45.92 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.67 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  44.14 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 321 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  42.36 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.45 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  41.26 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1612  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00249249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.49 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.26 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  48.23 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 224 aa  175  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.25 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.73 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 241 aa  174  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.02 
 
 		 271 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>