More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0844 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0844  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000660959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.02 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  46.09 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  48.68 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  49.56 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.56 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  48.88 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.25 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0095  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  46.46 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.89 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  46.43 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 406 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.13 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  43.11 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  43.11 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  46.82 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  44.89 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.95 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.29 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1127  heavy metal response regulator  45.91 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.22 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  46.02 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.79 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 229 aa  161  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  41.84 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.98 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.98 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  45.13 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.15 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  41.35 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.34 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  40.53 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>