More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0743 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  69.77 
 
 		 215 aa  316  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  54.25 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  49.3 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  38.81 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  30.56 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  35.87 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  35.32 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  32.73 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.49 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  31.7 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  33.03 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.03 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  33.03 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.03 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  30.41 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.03 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3490  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.49 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  32.57 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  31.19 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  31.94 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.57 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  30.69 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 635 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  29.95 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  28.64 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  30.73 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  30.23 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  29.03 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.85 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  29.02 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  28.9 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.08 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  32.59 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1233  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0842153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.26 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  30.09 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  30.09 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 635 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  30.09 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  30.09 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  30.09 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.81 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  27.98 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 597 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  32.14 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.14 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  32.14 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.46 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  32.14 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.6 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  28.77 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 799 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.63 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  28.76 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  28.76 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 263 aa  95.5  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>