More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0005 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  75.34 
 
 		 225 aa  358  4e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  48.15 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  29.91 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  33.02 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  33.02 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  33.02 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  28.57 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  30 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  27.98 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.32 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  27.98 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  26.82 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  28.31 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.04 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.04 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  26.34 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  27.43 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  26.96 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  32.16 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.34 
 
 		 425 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  35.38 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  30.04 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  29.68 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  39.62 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  25.66 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2186  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000654459  hitchhiker  0.000162526 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  25.7 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2914  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  27.96 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  28.9 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.85 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.81 
 
 		 709 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  27.14 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  29.15 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1396  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 367 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00425013  normal  0.314583 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 367 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0280  Fis family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3415  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1058  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000718409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.58 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 1053 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0778  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  29.29 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  24.07 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 636 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  26.52 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.76 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  25.62 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  25.62 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  25.6 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  30 
 
 		 682 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  25.13 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 453 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 379 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.29 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 542 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  23.83 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.72 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  21.56 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  27.7 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.11 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 898 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  29 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  22.9 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  26.46 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  24.75 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  24.42 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.86 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  24.2 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7053  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.79 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00262574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>