More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0892 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  33.77 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  33.19 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  32.14 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  31.7 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  39.68 
 
 		 566 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  29.02 
 
 		 219 aa  98.6  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  29.91 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  29.87 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  27.23 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  28.57 
 
 		 220 aa  95.5  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  28.21 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  28.38 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  27.93 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  29.82 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  28.57 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  28.32 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  26.43 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  26.99 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  26.87 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0969  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 328 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.82 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2494  two component transcriptional regulator  25.65 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.178511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2614  two component transcriptional regulator  25.65 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2501  two component transcriptional regulator  25.65 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  27.88 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  26.01 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.76 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.541096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1850  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.2 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0826767  hitchhiker  0.000859255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1724  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1676  two component transcriptional regulator  32.19 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  25.22 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  27.43 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2255  two component transcriptional regulator  26.2 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.47 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1233  DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0842153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  26.87 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  24.78 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  24.78 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.16 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  29.95 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 365 aa  85.1  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1946  transcriptional regulatory protein PhoP  24.89 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  26.34 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  26.72 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  29.38 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  25.22 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  29.26 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0968  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.730939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  25.33 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.01 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.44 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.52 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.59 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.26 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.95 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 652 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1234  EAL domain protein  28.77 
 
 		 589 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.89994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  28.44 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.07 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2804  two component transcriptional regulator  24.89 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000183823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  24.45 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.19 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  27.16 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  28.44 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  25.66 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  26.32 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1099  two component transcriptional regulator  28.15 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000014675  normal  0.683329 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  29.02 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.38 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  26.61 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  27.71 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  26.2 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  26.11 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>