More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1538 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 		 223 aa  261  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.3 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  37.61 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  39.73 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.73 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.62 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  34.93 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1153  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  36.84 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  41.96 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  36.84 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.84 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.07 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.17 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.73 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  38.46 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  36.73 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.56 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  38.43 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.56 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  38.36 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  40.81 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.16 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  37.77 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  37.66 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  36.48 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  37.39 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>