More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.19 
 
 		 239 aa  247  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1939  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  normal  0.104796 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0155  response regulator receiver domain protein  43.56 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.37446 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  38.36 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  38.36 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0643  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00269204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  41.52 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  41.89 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.59 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  37.33 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.06 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.22 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  36.6 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 321 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  38.4 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  36.6 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  33.48 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  40.61 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  34.05 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  34.05 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  34.05 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.56 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  34.05 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.04 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  33.48 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  35.4 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  34.76 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>