More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1939 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1939  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  normal  0.104796 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0155  response regulator receiver domain protein  53.39 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.37446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.79 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  39.24 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  39.24 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.83 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 239 aa  168  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  39.17 
 
 		 234 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0643  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00269204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 234 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  39.17 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  39.17 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  37.66 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  39.17 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  40.26 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 235 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 321 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.49 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 226 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  41.81 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  40.95 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.63 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  38.33 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  37.45 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  37.45 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  37.45 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  39.91 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  37.02 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40.34 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.24 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  41 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  36.44 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  36.29 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 230 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  36.86 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  35.59 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.06 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.93 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.19 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.19 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.19 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  37.19 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  37.19 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>