More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0155 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0155  response regulator receiver domain protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.37446 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1939  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  normal  0.104796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.56 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0643  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00269204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  42.6 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  42.6 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  41.88 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  41.88 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  41.45 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  41.45 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  41.45 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1023  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  36.77 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  40.43 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 261 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 237 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.67 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.39 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.76 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 242 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  38.22 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.81 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.78 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2076  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0826632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.07 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.33 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  37.84 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  33.19 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  35.4 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  35.87 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 321 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>