More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0749 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  32 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  31.62 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  33.93 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  32.57 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  30.88 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.52 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  32.86 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  32.11 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  32.24 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  30.77 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  28.11 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  29.09 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  28.11 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.73 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  26.94 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  30 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  25.46 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2283  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.11 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  28.84 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2615  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  25.79 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.5 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  28.17 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  24.88 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  25.81 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.27 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  25.35 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.96 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  26.37 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.79 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  24.42 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5142  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.27 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  25.58 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.17 
 
 		 616 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.81 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  25.35 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  25.35 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  24.88 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  24.09 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.28 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  24.88 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  27.63 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  25.35 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  25.12 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  23.5 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  25.58 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  29.73 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  27.8 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  23.74 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  25.35 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.04 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  25.12 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  23.04 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.9 
 
 		 425 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  29.5 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  25.35 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  25.93 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.07 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  24.89 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  24.54 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  24.54 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.12 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  24.78 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  23.5 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  23.66 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.61 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.01 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  23.56 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  28.5 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.57 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  25.89 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  28.86 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1408  two component transcriptional regulator  29.67 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.77 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.01 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.45 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.12 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  24.35 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.34 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  24.43 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  22.12 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.75 
 
 		 438 aa  79  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  24.19 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.12 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  28.5 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>