More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1884 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  100 
 
 
222 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  88.89 
 
 
221 aa  371  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  89.35 
 
 
224 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.89 
 
 
221 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 
221 aa  251  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  59.09 
 
 
221 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  58.72 
 
 
221 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 
221 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  58.33 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.48 
 
 
221 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  59.55 
 
 
220 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  59.55 
 
 
220 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 
221 aa  237  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 
225 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
220 aa  235  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  53.46 
 
 
221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  56.54 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 
236 aa  231  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
224 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 
223 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 
225 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1660  two component transcriptional regulator  59.35 
 
 
227 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 
257 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  53.24 
 
 
225 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.24 
 
 
225 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  51.14 
 
 
223 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.24 
 
 
225 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 
227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
222 aa  224  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  50.47 
 
 
221 aa  224  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 
225 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  48.4 
 
 
224 aa  224  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  52.97 
 
 
223 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  48.13 
 
 
219 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  48.6 
 
 
219 aa  222  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 
223 aa  218  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  47.73 
 
 
229 aa  217  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 
229 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  47.2 
 
 
219 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 
235 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 
223 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 
223 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.58 
 
 
227 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
222 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
222 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
222 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  46.26 
 
 
219 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
222 aa  207  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 
223 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 
222 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
226 aa  204  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 
223 aa  204  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  42.73 
 
 
224 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 
220 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 
231 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
230 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  44.95 
 
 
231 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 
222 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.65 
 
 
222 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 
220 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.58 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  51.4 
 
 
223 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  51.14 
 
 
221 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 
226 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
227 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.53 
 
 
222 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  45.5 
 
 
222 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.15 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
221 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 
231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  45.87 
 
 
224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
222 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  48.65 
 
 
223 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2935  two component transcriptional regulator  42.93 
 
 
229 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000047512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 
220 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 
221 aa  190  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  48.4 
 
 
223 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  50 
 
 
219 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.51 
 
 
219 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  46.51 
 
 
219 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  46.51 
 
 
219 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  40.37 
 
 
243 aa  188  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 
225 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 
219 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
224 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
224 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>