More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1917 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  76.13 
 
 		 222 aa  356  1.9999999999999998e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  51.13 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  43.12 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  35.32 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  34.72 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  33.94 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  33.64 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.27 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  35.16 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  33.33 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  34.17 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.63 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.96 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.61 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.54 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  33.33 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  33.33 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  32.73 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  33.04 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  33.04 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.3 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  33.04 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  32.72 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  28.05 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  28.05 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  28.05 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  30.63 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.39 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  33.95 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  32.27 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  28.91 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  30.04 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  31.05 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3440  response regulator receiver domain-containing protein  28.76 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.7 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  30.04 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1676  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.66 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.33 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  30.8 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  29.21 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  31.25 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  26.58 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.6 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.24 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.04 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.51 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1189  response regulator  25.89 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>