More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1773 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  51.83 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  42.01 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  44.84 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  38.81 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  36.7 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  34.56 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  38.31 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  35.19 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  38.31 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  38.01 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  37.81 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.02 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.88 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  34.56 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  34.1 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  32.72 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  38.14 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.64 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  32.44 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 225 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 225 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 273 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  29.6 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  31.63 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  32.41 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.34 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.65 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  32.87 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  31.96 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.83 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  34.56 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  34.09 
 
 		 232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2251  two component transcriptional regulator  30.81 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  31.8 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  32.26 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  29.3 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  29.63 
 
 		 221 aa  117  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.73 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  31.8 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2077  vncR, response regulator  34.86 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00119329  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  31.34 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>