More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1845 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  73.87 
 
 		 226 aa  334  7.999999999999999e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  52.23 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  46.61 
 
 		 229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  46.61 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1139  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.034136  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10550  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.04 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.85 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.27 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.27 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  39.01 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  36.99 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  37.17 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  38.67 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.98 
 
 		 227 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  37.33 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  37.1 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  34.98 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1970  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  39.91 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 406 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.59 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2301  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.82 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 283 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.59 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  35.29 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0612  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>