More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0272 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  100 
 
 		 223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  51.13 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  48.18 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  40.45 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  38.07 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  36.82 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  35.16 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  35.87 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  36.36 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  37.16 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  34.84 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  36.2 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  30.81 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  34.56 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.36 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  31.82 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.82 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  31.7 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  29.86 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  31.25 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  31.36 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.51 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.57 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  31.11 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  31.11 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  31.11 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  30.94 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  33.18 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  31.39 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.36 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.39 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1675  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.96 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.39 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.39 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  28.77 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  28.31 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  28.31 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  28.31 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  28.31 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  36.76 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  28.31 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  30.43 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.41 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1676  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.67 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  30.43 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  30.87 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>