More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1180 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  433  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.51 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1322  two component transcriptional regulator  52.36 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4138  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 282 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.03 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 273 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 266 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  48.86 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 247 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 247 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 247 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 250 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 224 aa  194  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 235 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 236 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.91 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  44.29 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  187  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  43.84 
 
 		 252 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  43.84 
 
 		 252 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  43.84 
 
 		 252 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  43.84 
 
 		 252 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  43.84 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  43.84 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  43.12 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.03 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.03 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.03 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.03 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.03 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.45 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  43.64 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.08 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  45.45 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.45 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.45 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  45.45 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.58 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>