More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1180 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  56.13 
 
 		 215 aa  238  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  54.25 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  49.53 
 
 		 216 aa  201  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  37.33 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  34.58 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.24 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  32.72 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.32 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.67 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.67 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.67 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  36.2 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.67 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.86 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  32.87 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  29.95 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1477  response regulator receiver  33.67 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.932866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.05 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  32.57 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4315  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.67 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.767231  normal  0.644171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  32.41 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  30.63 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1682  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000361446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  29.77 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.18 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  28.51 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  30.32 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 283 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.18 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01884  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  29.41 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000533293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01874  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000061937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  28.96 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4186  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.24384  normal  0.790942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.28 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2748  transcriptional regulatory protein YedW  29.41 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892088  normal  0.227347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  30.23 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3708  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.32 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2200  transcriptional regulatory protein YedW  29.41 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000454941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2070  transcriptional regulatory protein YedW  29.41 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.15395e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  30.45 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0752  hypothetical protein  30.91 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  30.59 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.39 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.85 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1729  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  30.59 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1676  transcriptional regulatory protein YedW  29.41 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000350308  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  30.59 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1216  transcriptional regulatory protein YedW  29.41 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000203871  normal  0.637592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  30.59 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0914  transcriptional regulatory protein YedW  29.41 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.57 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  31.7 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.17 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>