More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1871 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  91.48 
 
 		 227 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.3 
 
 		 240 aa  374  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.48 
 
 		 227 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.92 
 
 		 230 aa  347  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  69.33 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  69.33 
 
 		 222 aa  288  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.6 
 
 		 231 aa  285  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.56 
 
 		 223 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  68 
 
 		 222 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  68 
 
 		 222 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.86 
 
 		 222 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.23 
 
 		 223 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1844  response regulator receiver  58.15 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.73 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05980  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.01 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.553702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  48.68 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  48.46 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.93 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.98 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  49.1 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  38.1 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.05 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  46.22 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  41.81 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 250 aa  184  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.78 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.29 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  39.57 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  44.1 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  45.37 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  39.83 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  39.83 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  39.83 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.83 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.83 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  39.83 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  39.83 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 250 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40 
 
 		 256 aa  174  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>