More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1240 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.19 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  50.9 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  51.35 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.81 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  41.75 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.26 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.22 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 268 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.49 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.61 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.42 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.69 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  43.7 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  38.75 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.3 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.3 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  40.26 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  39.57 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.74 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.3 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.86 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  42.41 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.09 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4138  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  42.92 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  40.95 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  42.92 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>