More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4138 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4138  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 245 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 229 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  48.46 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 222 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  48.68 
 
 		 222 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5698  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  47.83 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.52 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.02 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  46.46 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  46.93 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 232 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  45.33 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  45.33 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.64 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  38.96 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.35 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 232 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.5 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.51 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  38.86 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.98 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  46.05 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  46.32 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  47.11 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1099  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2356  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.020915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3029  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5525  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.997238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  40.79 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  36.28 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1539  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.26981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 226 aa  165  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  40.43 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  40.43 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.09 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  40.43 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.47 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.54 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>