More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1539 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1539  response regulator receiver protein  100 
 
 		 219 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.26981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5698  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.01 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1693  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2151  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.15 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000920449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1447  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.27 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1695  response regulator receiver  56.11 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.88 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.64 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  45.09 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  45.58 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  45.81 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3029  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 235 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.34 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  45.81 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4138  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  44.2 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.27 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  43.3 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.92 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  42.34 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  46.22 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  44.2 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  44.14 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  41.36 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.36 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  43.38 
 
 		 334 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 235 aa  157  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 238 aa  157  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  43.3 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  43.3 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.05 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  41.36 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.11 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.99 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3763  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1238  response regulator receiver  50 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>