More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7254 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.21 
 
 		 233 aa  309  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  62.72 
 
 		 229 aa  281  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  64.32 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  60.89 
 
 		 226 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.29 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  61.5 
 
 		 228 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  56.19 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  60.18 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  55.31 
 
 		 334 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  59.28 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.56 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  57.96 
 
 		 226 aa  227  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  54.63 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  51.56 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 321 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.36 
 
 		 256 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.73 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  39.01 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  43.32 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  43.32 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.74 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.52 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  45.66 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  39.81 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  42.86 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.24 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  39.81 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  40.72 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  42.6 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.86 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1539  response regulator receiver protein  45.09 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.26981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  40.27 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3029  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>