More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1768 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  96.44 
 
 		 226 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.25 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  62.72 
 
 		 225 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.88 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  63.6 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 228 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.44 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 229 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  61.84 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  56.64 
 
 		 334 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  56.58 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  60.53 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  54.15 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.82 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.81 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  45.58 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  44.69 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 263 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  47.85 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  47.87 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  42.49 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  46.7 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  40.79 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  44.2 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  40.81 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.36 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  40.61 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  41.26 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.11 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 321 aa  154  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  37 
 
 		 240 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.48 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  38.29 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>