More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3363 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  73.21 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  70.74 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  68.56 
 
 		 229 aa  301  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  67.56 
 
 		 226 aa  292  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.08 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  62.16 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.61 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  63.6 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  63.27 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  57.96 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  57.52 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 224 aa  248  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.73 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  61.78 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  57.89 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  54.82 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  45.74 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  43.04 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.81 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3029  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  42.99 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  40.18 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.81 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  41.13 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  41.13 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  42.17 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.36 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  42.49 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 248 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  43.44 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 248 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  40.54 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  41.59 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.41 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 251 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  39.27 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  39.27 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.26 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  44.64 
 
 		 297 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>