More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1316 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  51.56 
 
 		 244 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  51.56 
 
 		 244 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.54 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.99 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  51.77 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  51.74 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  53.68 
 
 		 250 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.22 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  48.52 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  48.52 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.33 
 
 		 222 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.82 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 265 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 265 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.75 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 251 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.72 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  47.76 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.48 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.44 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  42.36 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  42.36 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  44.64 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.22 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.09 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.33 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.54 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  41.23 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>