More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5007 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  63.88 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  65.07 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  63.44 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  64.29 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.08 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  60.09 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  54.35 
 
 		 334 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.87 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  55.26 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.54 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  50 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  44.89 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  44.89 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.48 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  43.5 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.89 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  40.99 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  37.28 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  40.99 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 241 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 237 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  40.54 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  39.38 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  33.78 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.84 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.15 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.72 
 
 		 239 aa  148  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  37.55 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  37.55 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  34.22 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  42.15 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  39.13 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.64 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  37.83 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>