More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5447 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  100 
 
 		 228 aa  443  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  92.95 
 
 		 228 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  67.26 
 
 		 230 aa  288  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  69.03 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  60.53 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.84 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  61.4 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  61.5 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  61.84 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  61.06 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  62.28 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.08 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.83 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  55.07 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  54.63 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.56 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  49.11 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  43.29 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  40.81 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.62 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.27 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.09 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.79 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.79 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.54 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  37.93 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.63 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0531  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.602411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 321 aa  165  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.98 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  42.86 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  42.27 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>