More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0587 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.78 
 
 		 224 aa  350  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2151  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000920449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5698  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.38 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1539  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.26981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.56 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.46 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.2 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.81 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.36 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  43.11 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  38.74 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  41.78 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  41.67 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 252 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.79 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  42.6 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  42.73 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1238  response regulator receiver  44.68 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  39.38 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  43.36 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  42.04 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  41.26 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  34.84 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  36.44 
 
 		 256 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  39.46 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>