More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1781 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  100 
 
 		 226 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  96.44 
 
 		 229 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.56 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  60.89 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  63.56 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  61.95 
 
 		 228 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.44 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 		 235 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  61.06 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  56.95 
 
 		 334 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  56.28 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  61.33 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  54.67 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.54 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.83 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  45.29 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  43.78 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  43.95 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  41.96 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  157  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  47.59 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  43.3 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  39.19 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  45.95 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 321 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  39.04 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  41.59 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.41 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>