More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1606 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  69.64 
 
 		 228 aa  297  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  67.26 
 
 		 228 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  64.6 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  63.84 
 
 		 228 aa  277  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  67.57 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  61.33 
 
 		 229 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  59.56 
 
 		 226 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  57.59 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.16 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.59 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.92 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  51.34 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.89 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  46.82 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  48.18 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  40.64 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  43.24 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  37.05 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36.61 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  36.4 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  43.05 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.29 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  41.82 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  38.26 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.14 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1539  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.26981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 240 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  37.77 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>